אגף המנהל מטפל בנושאי משאבי אנוש, מחשוב ותחזוקת המרכז

אגף קשרי חוץ אחראי על שימור הקשר עם בוגרי המרכז וידידיו הרבים

יעודה של המחלקה ביישום החזון הבינתחומי בהיבטי המחשוב, התוכנה והתקשורת

אמונה על טיפוח תדמיתו של המרכז הבינתחומי הרצליה

סגנית הנשיא לענייני סטודנטים אחראית על כל היחידות המספקות שירותים לסטודנטים